Nationella referenslaboratorier för enterovirus
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter samt övriga funktioner NRL tillhandahåller.
Omfattning
Coxsackievirus, echovirus, poliovirus, övriga entero- och parechovirus.
Fördelning av uppdrag
För frågor kring diagnostik hänvisas till Karolinska Universitetssjukhuset respektive Folkhälsomyndigheten enligt nedanstående förteckning. För övriga frågor kontaktas Karolinska Universitetssjukhuset om det inte är tydligt att frågan hanteras av Folkhälsomyndigheten.
| Analys | Metod | Svarstid | Ansvarigt Laboratorium | Avgift |
|---|---|---|---|---|
| Primärdiagnostik enterovirus (inklusive coxsackie- echovirus samt parechovirus) | Realtids-PCR | 1–4 dagar | Karolinska Universitetssjukhuset | 1 630 kr |
| Enterovirus-D68 | Realtids-PCR | 1–4 dagar | Karolinska Universitetssjukhuset | 1 630 kr |
| Enterovirus/rhinovirustypning | Sekvensering | 1–2 veckor (a) | Karolinska Universitetssjukhuset | 2 598 kr |
| Typning vid verifierad enterovirusinfektion. Avser prov inom ramen för polioövervakning | Molekylära metoder | 20 dagar | Folkhälsomyndigheten | 0 kr |
(a) 2–4 dagar svarstid vid akut frågeställning.
| Referensmaterial | Avgift | Laboratorium/Företag |
|---|---|---|
| Odlad stam av enterovirus (echovirus 30 (E30)) | 540 kr/stam (a) | Karolinska Universitetssjukhuset |
| Avidentifierade patientprover(begränsad omfattning) | 540 kr/prov (a) | Karolinska Universitetssjukhuset |
(a) Transportkostnad tillkommer.
Expertstöd
Vid Karolinska Universitetssjukhuset finns virologisk kompetens på överläkarnivå alltid tillgänglig under laboratoriets öppettider. Vid behov av akut konsultation finns expertkompetens på enterovirus i allmänhet tillgänglighet. Expertkompetens garanteras via aktiv forskning och deltagande i europeiska nätverk, fr.a. European Non-Polio Enterovirus Network (ENPEN).
Folkhälsomyndigheten är delaktig i utbrottshantering med expertkompetens samt deltar aktivt i globalt polionätverk.
Utveckling och samverkan
Karolinska Universitetssjukhuset har tillgång till sekvensering och typning av genregionerna VP1 och VP4/VP2 för enterovirus och rhinovirus. NGS-baserad helgenomsekvensering för enterovirus D68 utförs i samarbete med Clinical Genomics, SciLifeLab och arbete med att etablera helgenomsekvensering av andra typer av enterovirus och rhinovirus pågår.
Folkhälsomyndigheten arbetar med utveckling av genomtypning samt övervakning i avloppsvatten inom EU-Wish.
Omvärldsbevakning och beredskap
Karolinska Universitetssjukhuset bedriver omvärldsbevakning som ett led i deltagandet i europeiska nätverk och forskning samt bedriver under säsongsövervakning av cirkulationen av EV-D68 i luftvägsprover.
Folkhälsomyndigheten bedriver kontinuerlig omvärldsbevakning som utvärderas och distribueras till nationella intressenter. Myndigheten får kontinuerliga rapporter från ECDC och WHO.