Nationella referenslaboratorier för retrovirus

Omfattning

Humant immunbristvirus typ 1 och 2 (HIV-1, HIV-2), humant T-lymfotropt virus typ 1 och 2 (HTLV-1, HTLV-2).

Fördelning av uppdrag

Karolinska Universitetssjukhuset ansvarar för HIV-1 diagnostik och Region Skåne ansvarar för HIV-2. Universitetssjukhuset, Örebro ansvarar för HTVL-1, HTVL-2 diagnostiken.

Mer om HTLV: Våra nationella referenslaboratorium (vardgivare.regionorebrolan.se)

För frågor kring diagnostik hänvisas till respektive laboratorium enligt nedanstående förteckning (tabell 1).

Referensdiagnostik

(a) Analysen utförs på vardagar.

Referensmaterial

De vanligaste analyserna för HIV-1 förses med referensmaterial från kommersiella källor. Tillgängligheten av dessa bestäms av respektive företag och sker genom regelbundna utskick enligt etablerade rutiner. Information om vilka leverantörerna till referensmaterial är för nuvarande framgår av tabell 2. En uppdatering av tabellen kan ske vid eventuella förändringar liksom förmedling av denna information till relevanta laboratorier. Avgiften för angivna kommersiella källor bestäms av anlitat företag/organisation och debiteras direkt från dessa till användaren.

Karolinska Universitetssjukhuset kan, om det finns behov för ytterligare referensmaterial, ta fram sådant med hjälp av en mycket stor biobank av patientprover (plasma), resistenstestade och subtypade för att skapa paneler för ytterligare kvalitetssäkring.

Klinisk Mikrobiologi, Region Skåne, har en biobank av prover (plasma, serum och likvor) med känd nivå av HIV-2 RNA och serumprover med antikroppar mot HIV-2 höljeprotein. Dessutom, via Lund Universitets viruscentrum kan HIV-2 framodlas och material som innehåller önskad mängd HIV-2 RNA kan förberedas.

Expertstöd

På Karolinska Universitetssjukhuset finns expertkunskap inom HIV som erbjuder stöd vid utredning av patient med misstänkt infektion, hantering av större och/eller oväntade spridningar av virus, för rådgivning till laboratorier vid etablering, validering och kvalitetssäkring av tester, allmän eller specifik kunskapsförmedling. Klinisk mikrobiologis expert kan även förmedla expertstöd från relevant klinisk expertis inom aktuella områden (infektionskliniker m.fl). Detta stöd kan erhållas med kort varsel. Stöd kan även ges mer övergripande via det nationella kvalitetsregistret för hiv i Sverige, InfCareHIV, där representant från Klinisk mikrobiologi är adjungerad till styrgrupp liksom nära samarbetspartner med Infektionskliniken, Karolinska Universitetssjukhuset

Vid Universitetssjukhuset i Örebro finns expertkunskap inom HTLV som erbjuder stöd och rådgivning vid utredning av patient eller diagnostikproblem avseende HTLV. Stöd i diskussion av val av primärdiagnostiska analyser, uppdatering av epidemiologisk information av aktuell nationell och internationell epidemiologi samt stöd i hantering av sjukdomsfall och uppföljning av HTLV-infekterade. Vid behov kan kontakter med internationella experter erbjudas.

Klinisk mikrobiologi och vårdhygien, Region Skåne erbjuder medicinskt stöd och rådgivning vid utredning av patienter med HIV-2 infektion, och metodtekniskt stöd vid validering och kvalitetssäkring samt implementering av HIV-2 specifika metoder för serologi och PCR.

Utveckling och samverkan

Vid Klinisk mikrobiologi, Karolinska Universitetssjukhuset, finns seniora HIV forskare/läkare som deltar i internationella nätverk och har samarbeten med bland annat WHO och ECDC. Laboratoriet utvecklar nya diagnostiska HIV-tester när kliniskt behov har identifierats. Nya diagnostiska tester sker primärt via in-house metoder etablerade med laboratoriets HIV forskare/läkare och/eller via inhämtning av kunskap från det internationella nätverket varefter metoderna implementeras.

Laboratoriet välkomnar samverkan med svenska och internationella aktörer såsom andra mikrobiologiska laboratorier. Vidare bidrar laboratoriet till en evidensbaserad hälso- och sjukvård inom HIV-området genom att överföra egna och andras forskningsresultat till praktisk vård och fortlöpande utvärdera etablerade och nya metoder. Laboratoriet bedriver forskning inom HIV-1 området inriktat mot omvärldsbevakning av spridning av olika HIV-1 stammar, uppkomst av nya HIV1 stammar, identifiering och kvantifiering av HIV-1 cellulära reservoarer och identifiering av HIV-bärande, ej diagnostiserade personer samt kartlägger i vilken utsträckning spridning sker bland migranter efter ankomst till Sverige. NRL-ledare Anders Sönnerborg medverkar i kvalitetssäkring av HIV vård i Sverige, medverkar i Referensgruppen för Antiviral Terapi (RAV) skrivande av guidelines för behandling och monitorering för HIV-1 och HIV-2 infektion, är grundare av och medlem i styrgruppen i EuResist, en europeisk akademiskt konsortium som driver världens största databas med HIV-resistenssekvenser kombinerat med kliniska data, är expertkonsult till WHO angående HIV-resistens.

Vid Klinisk mikrobiologi Universitetssjukhuset Örebro finns erfarenhet av HTLV-infektioner och kan erbjuda möjligheter att samverka i kvalitets-, utvecklings- och forskningsarbeten med andra laboratorier och kliniker. Vi medverkar i uppbyggnaden av kliniska kohorter för uppföljning av HTLV-infekterade i Sverige. Under senare år har laboratoriet samarbetat framförallt med Infektionsklinikens läkare vid Karolinska Universitetssjukhuset, Huddinge kring utveckling av viral load och betydelsen av att följa viral load. Projekt genomförs och presenteras vid nationella möten och samverkan sker regelbundet med Imperial College London.

Vid Klinisk mikrobiologi och vårdhygien, Region Skåne finns kapacitet för att vid behov utvärdera och utveckla nya diagnostiska analyser för HIV-2. Laboratoriet har kopplingar till forskare vid Lunds Universitets viruscentrum (LUVC) och infektionskliniker vid Skånes Universitetssjukhus. Dessa bedriver forskning inom HIV-2 fältet och är tillsammans med ansvarig läkare på Klinisk mikrobiologi även kopplade till nätverket inom SWE-GUB CORE grupp (Sweden Guinea-Bissau cohort research group) vilket inkluderar internationella samarbeten med HIV-2 forskare i Guinea-Bissau, Portugal, England och Japan. Inom dessa samarbeten pågår forskning rörande diagnostik och behandlingsuppföljning, samt prekliniska studier som syftar till utveckling av vaccin och botande behandling. Genom samarbete med forskare på LUVC kan kontakt förmedlas med forskare och HIV-2 kliniker i England och Portugal gällande forskningsstudier inom humoral- och cellulär immunitet och virusevolution för HIV-2.

Omvärldsbevakning och beredskap

Vid Klinisk mikrobiologi, Karolinska Universitetssjukhuset bedrivs omvärldsbevakning som ett led i deltagandet i forskning, internationella nätverk och samarbeten med Folkhälsomyndigheten, European Center for Disease Control, och UNAIDS / WHO. Seniora forskare vid laboratoriet följer regelbundet utveckling i omvärlden genom ett flertal mekanismer, deltagande i internationella kongresser/konferenser, internationella forskningsprojekt samt kontakter med sakkunniga inom ämnesområdet. NRL-ledare Anders Sönnerborg var tidigare medlem i Scientific Advisory Board in Antivirals/HIV vid European Medicines Agency och har fortsatt nära kontakter varvid relevant information om planerade studier av potentiella nya läkemedel för HIV och/eller registrering kan erhållas. Vid identifiering av utbrott och nya behov har laboratoriet kapacitet att omprioritera resurser om akut behov av ny diagnostik eller förmedling av ny expertkunskap.

Vid Klinisk mikrobiologi, Örebro Universitetssjukhus bedrivs fortlöpande bevakning av HTLV-området genom deltagande i internationella konferenser och litteraturgenomgångar samt genom diskussion med kliniker avseende specifika fall.

Klinisk mikrobiologi och vårdhygien, Region Skåne bedriver omvärldsbevakning genom deltagande i nationella och internationella konferenser där resultat av metodutveckling presenteras och i förekommande fall publiceras. NRL-ledare Gülşen Özkaya Şahin är organisatör av ESCMID-konferenser inom HIV-fältet och är medlem i ESCMIDs executive committee med uppdrag att ta en aktiv roll i övervakning av diagnostik för bland annat HIV-2. Laboratoriet har kapacitet att ta emot ytterligare prover för kvantitativ PCR-analys HIV-2 om behov uppstår. Beredskap finns även för övriga analyser efter överenskommelse.