Nationella referenslaboratorier för bakteriell STI
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter samt övriga funktioner NRL tillhandahåller.
Omfattning
Nesseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Treponema pallidum, Haemophilus ducreyi, Ureaplasma urealyticum.
Fördelning av uppdrag
Vid frågor och diskussioner kontaktas Örebro Universitetssjukhus. Huvudansvar för individuella STI agens är enligt följande: Neisseria gonorrhoeae: Örebro, Mycoplasma genitalium: Örebro och Uppsala, Chlamydia trachomatis: Uppsala och Örebro, Treponema pallidum: Göteborg och Örebro, och Haemphilus ducreyi: Göteborg och Örebro.
För frågor kring diagnostik hänvisas till respektive laboratorium enligt nedanstående förteckning.
Referensdiagnostik
Universitetssjukhuset i Örebro, erbjuder serologisk och/eller genetisk typning samt verifiering av antibiotikakänslighet med MIC-bestämning eller med molekylärbiologisk metod. Verifiering av svårdiagnostiserade prover med serologiska, bakteriologiska och molekylärbiologiska metoder.
Akademiska Sjukhuset erbjuder serologisk och molekylärbiologisk diagnostik för C. trachomatis inklusive LGV diagnostik
Sahlgrenska Universitetssjukhuset, erbjuder serologisk och molekylärbiologisk verifiering av misstänkt aktuell eller latent syfilisinfektion inklusive neurosyfilis. Molekylärdiagnostik för T. pallidum, H. ducreyi, U. urealyticum och U. parvum.
| Analys | Metod | Svarstid | Ansvarigt laboratorium | Avgift |
|---|---|---|---|---|
| N. gonorrhoeae, verifiering, resistensbestämning | Odling | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 951 kr |
| N. gonorrhoeae, verifiering/ resistensbestämning/typning | Helgenomsekvensering | 2–3 veckor | Örebro Universitetssjukhus | 3 846 kr |
| N. gonorrhoeae och C. trachomatis, RNA | TMA | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 227 kr |
| N. gonorrhoeae, RNA, verifiering | TMA | 2–7 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 1 053 kr |
| M. genitalium, RNA och resistensbestämning för makrolider | TMA, och Sanger sekvensering | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 316 kr |
| M. genitalium, resistensbestämning för fluorokinoloner | TMA, och Sanger sekvensering för resistens | 2–14 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 1 253 kr |
| Syfilisdiagnostik, serologi | CLIA | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 47 kr |
| Syfilisdiagnostik, serologi | TPPA | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 411 kr |
| Syfilisdiagnostik, serologi | RPR | 2–3 dagar | Örebro Universitetssjukhus | 419 kr |
| C. trachomatis, DNA | PCR | 2–3 dagar | Akademiska Sjukhuset | 364 kr |
| C. trachomatis, Lymfogranuloma venereum (LGV) -typning | PCR, Sanger sekvensering | 2–4 dagar | Akademiska Sjukhuset | 723 kr |
| Chlamydia spp, IgM/IgG | Euroimmun MIF | 7 dagar | Akademiska Sjukhuset | 2 056 kr |
| C. trachomatis, genotypning | MLST | Enligt överenskommelse | Akademiska Sjukhuset | Ej fastställt |
| T. pallidum, DNA | Realtids-PCR | 1–7 dagar | Akademiska Sjukhuset | 678 kr |
| H. ducreyi, DNA | Realtids-PCR | 1–7 dagar | Akademiska Sjukhuset | 678 kr |
| U. urealyticum, U. parvum och M. hominis, DNA | Multiplex-PCR | 1–7 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 724 kr |
| Treponema spp, screening IgM/IgG | ELISA | 1–3 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 151 kr |
| T. pallidum, IgM | ELISA | 1–5 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 1 787 kr |
| T. pallidum, konfirmationstest | Hemagglutination (TPHA) | 1–5 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 566 kr |
| T. pallidum, konfirmeringstest | Venereal Disease Research Laboratory (VDRL) | 1–5 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | Ej fastställt |
Referensmaterial
Universitetssjukhuset Örebro tillhandahåller referensstammar för diagnostik och antibiotikakänslighet, kontrollmaterial för molekylärbiologisk diagnostik liksom små volymer av serumprov i tillämpliga fall.
Akademiska sjukhuset tillhandahåller kontrollmaterial för molekylärbiologisk diagnostik liksom serumprover. C. trachomatis-odling utförs inte inom primärdiagnostik men referensstammar finns tillgängligt.
Sahlgrenska Universitetssjukhus kan tillhandahålla kontrollmaterial för molekylärbiologisk diagnostik och små volymer av serumprov.
| Referensmaterial | Avgift | Laboratorium/Företag |
|---|---|---|
| N. gonorrhoeae, M. genitalium, C. trachomatis, T. pallidum | Självkostnadspris | Universitetssjukhuset Örebro |
| M. genitalium, C. trachomatis, T. pallidum | Självkostnadspris | Akademiska sjukhuset |
| T. pallidum | Självkostnadspris | Sahlgrenska Universitetssjukhus |
Expertstöd
Universitetssjukhuset i Örebro erbjuder stöd i diskussion av diagnostiska analyser för N. gonorrhoeae, M. genitalium, C. trachomatis och T. pallidum, epidemiologisk information av aktuell nationell och internationell epidemiologi samt stöd vid hantering av enstaka sjukdomsfall och utbrott. Laboratoriet utför regelbunden utvärdering av nya kommersiella tester på marknaden. Dessa görs publika genom publikationer, presentationer och/eller postrar i samband med vetenskapliga konferenser (nationella och internationella).
Akademiska Sjukhuset erbjuder stöd i diskussion av diagnostiska analyser för C. trachomatis och M. genitalium samt erbjuder stöd i hantering av enstaka sjukdomsfall och utbrott.
Sahlgrenska Universitetssjukhuset erbjuder stöd i diskussion av diagnostiska analyser för T. pallidum, H. ducreyi och U. urealyticum samt erbjuder stöd i hantering av enstaka sjukdomsfall och utbrott.
Utveckling och samverkan
Alla tre samverkande laboratorierna inom NRL har gedigen erfarenhet av och erbjuder möjligheten att samverka i kvalitets-, utvecklings- och forskningsarbeten med andra laboratorier eller kliniker.
Omvärldsbevakning och beredskap
Alla tre samverkande laboratorierna följer den svenska och globala epidemiologin och metodutvecklingen inom området (via Folkhälsomyndigheten, European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) och World Health Organization (WHO)). Huvudansvarigt laboratorium, Universitetssjukhuset Örebro leder även liknande referensfunktioner inom European Union/European Economic Area (EU/EEA) för ECDC samt en global referensfunktion för WHO. Beredskap finns för tillfälligt ökad referensfunktion vid exempelvis en utbrottssituation i landet.