Nationellt referenslaboratorium för Icke-endemiska flavivirus och alphavirus
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter samt övriga funktioner NRL tillhandahåller.
Omfattning
Denguevirus, gula febern-virus, Japansk Enchephalit Virus (JEV), zikavirus, chikungunya, rossriver, usutu, westnile, O'nyong-nyong virus och amerikanska arbovirus.
Referensdiagnostik
Folkhälsomyndigheten tillhandahåller nedanstående analyser på i första hand helblod/serum beroende på frågeställning också andra provmaterial så som cerebrospinalvätska, urin med mera.
Inom referensdiagnostiken ingår vissa analyser för andra virus än flavivirus eftersom de kan vara aktuella för differentialdiagnostik i samband med flavivirusdiagnostik.
| Analys | Metod | Svarstid | Avgift |
|---|---|---|---|
| Denguevirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| Denguevirus, IgM | ELISA | 7 dagar | 1 480 kr |
| Denguevirus, IgG | IF | 7 dagar | 605 kr |
| Denguevirus, typning | Sekvensering | Enligt överenskommelse | Enligt överenskommelse |
| Gulafebernvirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| Gulafebernvirus, IgM | IF | 7 dagar | 605 kr |
| Gulafebernvirus, IgG | IF | 7 dagar | 1 490 kr |
| Japansk encephalitvirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| Japansk encephalitvirus, IgM | IF | 7 dagar | 605 kr |
| Japansk encephalitvirus, IgG | IF | 7 dagar | 1 480 kr |
| Usutuvirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| West Nilevirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| West Nilevirus, IgM | ELISA | 7 dagar | 860 kr |
| West Nilevirus, IgG | IF | 7 dagar | 1 480 kr |
| Zikavirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| Zikavirus, IgM | ELISA | 7 dagar | 1 535 kr |
| Zikavirus, IgG | ELISA | 7 dagar | 1 535 kr |
| Zikavirus, Neutraliserande antikroppar | NT | 15 dagar | 3 885 kr |
| Amerikanska encephalitvirus (Venezuelan-, Eastern Equine-, St Louis-, Western Equine encephalitisvirus), nukleinsyra, IgG | IF, PCR | Skickas till Bernhard Nocht Insitute | Debiteras av underleverantör |
| Chikungunya, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 2 545 kr |
| Chikungunya, IgM | ELISA | 7 dagar | 1 495 kr |
| Chikungunya, IgG | IF | 7 dagar | 605 kr |
| O'nyong-nyong virus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | Enligt överenskommelse |
| Ross-river, IgG | IF | 7 dagar | 1 480 kr |
| Chikungunya- och denguevirus, nukleinsyra | PCR | 3 dagar | 3 000 kr |
| Chikungunya- och denguevirus, IgM, IgG | ELISA, IF | 7 dagar | 2 800 kr |
| Tillägg vid virusisolering i BSL3 laboratorium | Odling | – | 9 570 kr |
| Tillägg vid extraktion i BSL3 laboratorium | – | – | 2 120 kr |
Referensmaterial
Folkhälsomyndigheten tillhandahåller referensmaterial utan kostnad vid förfrågan, framförallt för material som inte finns att tillgå från kommersiella aktörer. Beställaren står för transportkostnaden.
Expertstöd
Folkhälsomyndigheten ger expertstöd och rådgivning till behandlande läkare och laboratorier angående utredningar av patienter där misstanke om flavivirusinfektion eller relevanta differentialdiagnoser föreligger.
Utveckling och samverkan
Verksamheten utvecklar och validerar nya metoder vid behov själva eller i samverkan med andra internationella laboratorier. Den omfattande omvärldsbevakning som finns vid myndigheten ligger till grund för beslut om etablering av nya diagnostiska metoder. Vidare finns ett nära samarbete med Enheten för beredskap och krishantering som vid myndigheten ansvar för framtagande av nationella handlingsplaner för smittämnen med risk för omfattande samhällsspridning. Folkhälsomyndigheten deltar även i Emerging Viral Diseases-Expert Laboratory Network”, EVD-labnet, ett nätverk av europeiska laboratorier med expertis inom vektorburna/zoonotiska virala smittämnen.
Omvärldsbevakning och beredskap
Folkhälsomyndigheten får via sitt IHR uppdrag tidigt ta del av en rad olika internationella utbrottsvarningar (t.ex. EWRS, ECDC- och WHO kommunikation). Verksamhetschefen är dessutom national microbiological focal point för ECDC och myndigheten får dagliga uppdateringar från ECDC om aktuella internationella smittskyddsrelevanta händelser. Myndigheten har också genom sitt samordningsansvar gentemot landets smittskydd löpande kontakt med landets samtliga smittskyddsenheter och får på regelbundna veckomöten eller via mejlinformation om aktuella smittskyddshändelser runt om i landet. Myndighetens epidemiologer får vidare information om förekomst av anmälningspliktiga flavi- och alphavirus över hela Sverige via systemet för rapportering av anmälningspliktiga sjukdomar (SmiNet). En systematisk litteratur och mediabevakning finns på myndigheten som genom mejluppdateringar och dagliga möten förmedlas till den laborativa verksamheten.