Nationella referenslaboratorier för fästingburna bakterier
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter samt övriga funktioner NRL tillhandahåller.
Omfattning
Borrelia burgdorferi s.l., Borrelia miyamotoi, Rickettsia spp, Anaplasma phagocytophilum, Neoehrlichia mikurensis, Spiroplasma spp och bevakning av nya bakteriella fästingburna patogener.
Fördelning av uppdrag
NRL laboratorierna samarbetar inbördes kring metodutveckling, utbyte av material för metodvalidering samt för konfirmation av analysresultat. Samtliga tre laboratorier kan företräda den nationella referensfunktionen men vid specifika frågor hänvisas till respektive laboratorium enligt tabell 1.
Region Jönköpings län har huvudansvar för Borreliadiagnostik inklusive Borrelia miyamotoi (fästingburen återfallsfeber).
Sahlgrenska Universitetssjukhus har huvudansvar för Neoehrlichia mikurensis, Anaplasma phagocytophilum och Spiroplasma ixodetis.
Akademiska sjukhuset har huvudansvar för diagnostik av infektioner orsakade av inhemska Rickettsia-arter.
Referensdiagnostik
Analys | Metod | Svarstid | Ansvarigt laboratorium | Avgift |
---|---|---|---|---|
Borrelia, IgG (serum) | CLIALiaison Borrelia IgG, DiaSorin, Saluggia, Italien | 1–4 dagar | Region Jönköping | 241 kr |
Borrelia IgM (serum) | CLIABorrelia VirClia IgM Monotest, Vircell, Granada, Spanien | 1–4 dagar | Region Jönköping | 241 kr |
Borrelia-specifikt IgG-antikroppsindex | Liaison Borrelia IgG, DiaSorin, Saluggia, Italien | 1-4 dagar | Region Jönköping | 995 kr |
Borrelia-specifikt IgG-antikroppsindex | LuminexrecomBead Borrelia IgG, Mikrogen GmbH, Neuried, Tyskland | 1–7 dagar | Region Jönköping | 2 259 kr |
Konfirmationstest Borrelia IgG (serum) | ImmunoblotEUROLINE Borrelia RN-AT IgG EUROIMMUN AG, Lübeck, Tyskland | 1–7 dagar | Region Jönköping | 669 kr |
Konfirmationstest Borrelia IgM (serum) | ImmunoblotEUROLINE Borrelia RN-AT IgM EUROIMMUN AG, Lübeck, Tyskland | 1–7 dagar | Region Jönköping | 669 kr |
CXCL13-analys (cerebrospinalvätska) | Immunkromatografi, ReaScan CXCL13 Reagena Oy, Toivala, Finland | 1–4 dagar | Region Jönköping | 1 846 kr |
Borrelia-DNA (cerebrospinalvätska, ledvätska eller biopsimaterial) | realtids-PCR (16S rRNA) | 1–7 dagar | Region Jönköping | 823 kr |
Borrelia miyamotoi-DNA i cerebrospinalvätska, plasma eller serum, | realtids-PCR (flaB) | 1–7 dagar | Region Jönköping | 883 kr |
Anaplasma phagocytophilum IgG (serum) | IFAAnaplasma phagocytophilum IFA IgG, Focus Diagnostics, Cypress, CA, USA | 1–7 dagar | Region Jönköping | 410 kr |
Anaplasma phagocytophilum-DNA (plasma eller helblod, EDTA) | realtids-PCR (gltA) | 1–7 dagar | Region Jönköping | 1 297 kr |
Neoehrlichia mikurensis-DNA (plasma) | Realtids-PCR (groEL) | 1-7 dagar | Region Jönköping | 1 297 kr |
Rickettsiaspp-DNA (plasma) | Realtids-PCR (gltA) | 1-7 dagar | Region Jönköping | 1 297 kr |
Anaplasma phagocytophilum IgG (serum) | IFAAnaplasma phagocytophilum IFA IgG, Focus Diagnostics, Cypress, CA, USA | 1–7 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 795 kr |
Anaplasma phagocytophilum-DNA (helblod, EDTA) | realtids-PCR (groEL) | 1–7 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 678 kr |
Neoehrlichia mikurensis-DNA (plasma) | realtids-PCR (groEL) | 1–7 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 678 kr |
Spiroplasma ixodetis-DNA (plasma) | 16S rRNA PCR och sekvensering | 2–7 dagar | Sahlgrenska Universitetssjukhus | 678 kr + 1 623 kr |
Rickettsia spp, IgG och IgM(serum/plasma) | IFA | 1–4 dagar | Akademiska Sjukhuset | 1 399 kr |
Rickettsia spp-DNA (cerebrospinalvätska/ ledvätska/ punktat/ buffy coat / sårsekret/ vävnadsbiopsi) | PCR | 1–4 dagar | Akademiska Sjukhuset | 974 kr |
Isolering av Rickettsia arter (efter föregående kontakt med labbet) | Cellkultur | 1–4 veckor | Akademiska Sjukhuset | Ej fastställd |
Referensmaterial
Region Jönköpings Län bjuder in till samarbete kring metodutvärderingar och kan med det bidra med provmaterial från laboratoriets biobank. Vid ett eventuellt samarbete kan laboratoriet bistå med antikroppspositiva Borrelia serumprover från kliniskt och serologiskt välkaraktäriserade patienter. Antikroppsnegativa Borreliaprover från blodgivare samt kliniskt och serologiskt utvärderade patienter.
Referensmaterial | Avgift | Laboratorium/Företag |
---|---|---|
Borrelia (stammar) Kliniska isolat av B. afzelii, B. garinii och B. burgdorferi s.s. | 2 500 kr/isolat | Region Jönköping |
Extraherad nukleinsyra (olika fästingburna agens) från positiva och negativa fästingmaterial. | 1 500–2 000 kr | Region Jönköping |
DNA-extrakt från kliniskt material (Neoehrlichia) | Enligt överenskommelse | Sahlgrenska Universitetssjukhus |
Kontrollmaterial (Rickettsia) för molekylärbiologisk och serologisk diagnostik kan efter överenskommelse tillhandahållas i begränsad omfattning. | Enligt överenskommelse | Akademiska Sjukhuset |
Expertstöd
Region Jönköping bistår med stöd efter förfrågan för utredning av patient med misstänkt fästingburen infektion, primär som bekräftande diagnostik. Laboratoriet bistår även med material och expertstöd vid metodval, validering och implementering, framförallt inom borreliadiagnostik. Kontrollmaterial, second opinion och verifiering av fynd med annan/kompletterande metod. Laboratoriet bidrar även i flerlabsjämförelser för Anaplasma-serologi och CXCL13.
Sahlgrenska Universitetssjukhus bistår med stöd i utredning och diagnostik av infektion med Neoehrlichia mikurensis, Anaplasma phagocytophilum och Spiroplasma ixodetis samt kan bistå med metodstöd för diagnostik av N. mikurensis, A. phagocytophilum och S. ixodetis. Laboratoriet ansvarar för Equalis kvalitetsprogram för neuroborrelia-diagnostik.
Akademiska Sjukhuset bistår med stöd i utredning och diagnostik av infektion med Rickettsia arter samt kan bistå med metodstöd för diagnostik av Rickettsia arter. Laboratoriet bistår även med second opinion och verifiering av fynd med annan/kompletterande metod (Western blot, ddPCR).
Alla tre laboratorier inom NRL delger information om ny kunskap på SLIMs webbportal, via nätverkets digitala forum samt genom aktivt deltagande i Svenskt Vårmöte för Infektion och Mikrobiologi (SVIM).
Utveckling och samverkan
Region Jönköping arbetar med att sätta samman välkaraktäriserade paneler för utvärdering av serologiska respektive molekylärbiologiska metoder för påvisning av B. burgdorferi sensu lato-infektion. Laboratoriet samverkar i ett skandinaviskt och europeiskt nätverk i frågor gällande diagnostik, behandling och forskning om borrelios och andra fästingburna infektioner. Laboratoriet har även nära samarbete med ett flertal laboratorier och kliniker inom landet, samt samverkar i viss mån med industrin gällande utvärdering av nya tester och analysmetoder samt kartläggning av seroprevalens för flera fästingburna infektioner. För närvarande koordinerar laboratoriet två kliniska multicenterstudier (EMBio och SWEtick) vars syfte är att öka kunskapen om fästingburna sjukdomars förekomst, kliniska manifestationer och förlopp, samt för att utveckla, validera och tillgängliggöra laboratoriediagnostik för de mer ovanliga fästingburna infektionerna (”emerging tick-borne diseases”). Laboratoriet har deltagit i expertgruppen för framtagandet av Läkemedelsverkets nya behandlingsrekommendation för borreliainfektioner, i författandet av ett nordeuropeiskt konsensusdokument kring utredning och handläggning av fästingburna infektioner samt i pågående arbeten inom ESCMID Study Group for Borreliosis and Other Tick-Borne Diseases (ESGBOR) gällande epidemiologi, diagnostik och behandlingslängd vid borrelios.
Laboratoriemedicin i Jönköping är sedan 2019 en universitetssjukvårdsenhet och har en stor forskargrupp med stark förankring i rutinlaboratoriet och fästingrelaterade NRL-uppdrag samt vid Linköpings universitet. Forskargruppen bedriver bred forskning inom området fästingburna infektioner med huvudsakligt fokus på epidemiologi/riskbedömning, diagnostikutveckling och, för borrelia, immunrespons. Härifrån handleds ett flertal doktorander som är kliniskt verksamma lokalt såväl som inom andra regioner, och laboratoriet har många pågående forskningssamarbeten nationellt och internationellt med parter inom såväl hälso- och sjukvård som inom folkhälsa, ekologi och veterinärmedicin. NRL-funktionen har nära samverkan med både infektionsläkare och kliniska mikrobiologer i hela sydöstra sjukvårdsregionen (SÖSR) och för en dialog kring sjukvårdens behov för att på så sätt utforma våra analyspaket och remisser på ett sätt som motsvarar detta.
Sahlgrenska Universitetssjukhuset diagnosticerade det första fallet av infektion hos människa med Neoehrlichia mikurensis någonsin (tidigare benämnd ”Candidatus Neoehrlichia mikurensis”) och har fram till 2024 varit det enda laboratoriet i Sverige som erbjudit denna PCR-baserade diagnostik. Laboratoriet stöttar klinisk mikrobiologiska laboratorier i Norge, Danmark, Finland, Åland och Skottland med Neoehrlichia-diagnostik. Vidare arbetar laboratoriet med att utveckla serologisk diagnostik för N. mikurensis, något som inte finns idag. Laboratoriet har även validerat den A. phagocytophilum, pecifika realtids-PCR som erbjuds för kliniskt bruk med ett polskt patientmaterial. Laboratoriet diagnosticerat de första fallen av infektion med Spiroplasma ixodetis i Sverige, tack vare erfarenhet och expertis av 16S rRNA-PCR för diagnostik av svårodlade eller ickeodlingsbara bakterier, vilket inkluderar optimering av DNA-extraktion från humant material och sanger-sekvensering.
Akademiska Sjukhuset påvisade det första fallet av R. helvetica orsakad meningit 2010 och samma år även två fall av subakut meningit orsakad av Rickettsia felis. Med stöd av Vinnova har användbarheten av rekombinanta antigen för serologisk diagnostik (ELISA) utvärderats, validerats och förbereds för publikation. Laboratoriet har utvecklat och standardiserat en Western Blot metod baserad på GE/Amersham WB system för konfirmation av den serologiska reaktiviteten för fyra av spotted fever rickettsierna. Det pågår en utveckling av den molekylärbiologiska metodiken där alternativa målgener testas och instrument utvärderas, inkluderande ddPCR. Laboratoriet har ett flertal kliniska forskningsprojekt i samarbete med kliniker vid Akademiska sjukhuset samt samarbeten med universiteskliniker och mikrobiologiska laboratorier i Norden samt aktuellt samarbete med M.I.T, Dept of Biology, Cambridege, MA, USA avseende mekanismer för patogenes, spridning och rickettsiinfektionens påverkan i värdcellen. Department of Comparative Tropical Medicine and Parasitology, Ludwig-Maximilians-University,Munich har inlett ett samarbete kring den serologiska diagnostiken av rickettsiainfektioner liksom avseende serologisk differentiering och korsreaktivitet. Laboratoriet har även ett erfarenhetsutbyte med referenslaboratorium i Australien, enheten för Veterinär and Biomedicinsk vetenskap Murdoch Universitet avseende stamisolat och odlings-tekniker för spotted fever gruppens rickettsier. Laboratoriet är medlem i nätverket "Infection Ecology and Epidemiology" (One Health Sweden) liksom i American Society for Rickettsioses.
Omvärldsbevakning och beredskap
Genom aktivt deltagande i skandinaviska och europeiska nätverk (till exempel NSCMID, ESGBOR, NorthTick), konferensdeltagande och litteraturbevakning har NRL en god överblick över vilka diagnostikmetoder som används och är uppdaterade om nya riskområden, nya fästingburna agens och om utvecklingen inom diagnostik, behandling och forskning. Inom de europeiska nätverksprojekten deltar NRL i screening av fästingar och reservoarer för såväl vårt lands nya fästingarter, nya bakteriella patogener och nya transmissionsvägar. Detta kompletteras av epidemiologiska studier av ”nya” fästingburna infektioner.
NRL-ledare från huvudansvarigt NRL är ordförande i ESCMID Study Group for Lyme Borreliosis and Other Tick-Borne Diseases och inom detta expertnätverk kommuniceras och diskuteras kontinuerligt det aktuella läget och dess utveckling. Nätverket samverkar kring kvalitetsutskick/flerlabsjämförelser, kunskapsutbyte och metoduppsättning.
NRL-ledare för Sahlgrenska Universitetssjukhus leder forskning om N. mikurensis och vid laboratoriet har flertal medarbetare disputerat på Neoehrlichia mikurensis. Laboratoriet har även beskrivit en ny infektionssjukdom, fästingburen spiroplasmos, som liknar anaplasmos, men skiljer sig från sjukdomsmanifestationerna som hittills varit kända för S. ixodetis i Europa – svåra ögoninfektioner hos nyfödda. Samarbete pågår med fransk forskargrupp för att förstå om det är samma bakterieart som orsakar dessa infektioner med Spiroplasma.
Laboratorierna i Region Jönköping och Sahlgrenska Universitetssjukhus samverkar även med referenslaboratorier för borrelia och andra fästingburna bakterier i Danmark, Skottland, Nederländerna, Frankrike, Tyskland och Schweiz. Vidare samverkar laboratorierna med svenska NRL för andra fästingburna mikroorganismer. Klinisk mikrobiologi i Jönköping har pågående samarbetsprojekt med NRL-laboratorierna för TBE-virus.
Vid Akademiska Sjukhuset leder NRL-ledare forskning om rickettsia infektioner i egen grupp och i samarbete med andra forskargrupper. Två medarbetare vid laboratoriet har disputerat på Rickettsia infektioner med NRL-ledare som huvudhandledare och en doktorand vid infektionskliniken vid Akademiska Sjukhuset har ett pågående arbete. Kunskapsutvecklingen inom området följs kontinuerligt, både avseende arternas utbredning, symptommanifestationer, utredning, behandling och diagnostikutveckling och dess relevans för rekommendationer och guidelines för hälso- och sjukvården. Avdelningen för Klinisk Mikrobiologi vid Akademiska Sjukhuset är det enda nationella och nordiska laboratoriet med diagnostik för rickettsia infektioner som kan erbjuda serologisk och molekylärbiologisk primärdiagnostik i rutinverksamhet i kombination med konfirmerande diagnostik som western blot och odling/isolering av rickettsier i cellkultur.