Nationella referenslaboratorier för hantavirus och sindbisvirus
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter samt övriga funktioner NRL tillhandahåller.
Omfattning
Hantavirus och Sindbisvirus.
Fördelning av uppdrag
Norrlands Universitetssjukhus diagnostiserar inhemska hantavirus, Puumalavirus och Folkhälsomyndigheten erbjuder diagnostik för hantavirus som förekommer i andra delar av världen. Folkhälsomyndigheten utför även diagnostik för Puumalavirus vid förfrågan.
För frågor kring diagnostik hänvisas till Norrlands universitetssjukhus respektive Folkhälsomyndigheten enligt nedanstående analysförteckning. För övriga frågor kontaktas Norrlands universitetssjukhus om det inte är tydligt att frågan hanteras av Folkhälsomyndigheten.
Referensdiagnostik
NRL bistår med rådgivning om provtagning och val av analys.
Norrlands universitetssjukhus utför PCR-analys med påvisande av Puumalavirus RNA samt serologi med påvisande av Puumalavirusspecifika IgM- och IgG-antikroppar. Vid frågeställning om aktuell sorkfeber utförs först Puumala virus PCR-analys och om denna blir negativ utförs även serologi. PCR-analys har fördelen att Puumalavirus RNA går att detektera hos nyligen insjuknade patienter som inte har hunnit utveckla antikroppar ännu samt hos patienter som har antikroppsbrist och därför kan vara negativa i serologin. Serologi kan däremot vara av värde senare i sjukdomsförloppet då RNA inte längre går att påvisa (viremin har gått över). Vid utredning av misstanke på nyligen genomgången infektion kan aviditetstest av IgG-antikroppar vara av värde.
Folkhälsomyndigheten utför diagnostik av både inhemskt Puumalavirus och importerade hantavirus samt bistår med rådgivning om provtagning och val av analys vid behov. PCR används vid prov taget kort tid efter insjuknandet och kan kompletteras med serologiska metoder.
Analys | Metod | Svarstid | Laboratorium | Avgift |
---|---|---|---|---|
Puumalavirus, nukleinsyra | PCR | 1 dag | Norrlands Universitetssjukhus | 1 229 kr |
Puumalavirus, IgM | ELISA | 2–3 dagar | Norrlands Universitetssjukhus | 771 kr |
Puumalavirus, IgM snabbtest | Reascan TM | 4 timmar (a) | Norrlands Universitetssjukhus | 723 kr |
Puumalavirus, IgG | ELISA | 2–3 dagar | Norrlands Universitetssjukhus | 771 kr |
Puumalavirus, IgG aviditet | IF | 7 dagar | Norrlands Universitetssjukhus | 386 kr |
Sindbisvirus, IgM | IF | 7 vardagar | Norrlands Universitetssjukhus | 346 kr |
Sindbisvirus, IgG | IF | 7 vardagar | Norrlands Universitetssjukhus | 454 kr |
Andesvirus, nukleinsyra | PCR | 12 timmar | Folkhälsomyndigheten | 2 445 kr |
Dobravirus, IgM (snabbtest) | Reascan | 1–3 dagar | Folkhälsomyndigheten | 825 kr |
Hantaanvirus, IgG | IF | 1–7 dagar | Folkhälsomyndigheten | 1 425 kr |
Neutraliserande antikroppar för seoul-, hantaan-, puumala, dobrava-, saarema-, andes-, sin mombre- och tulavirus | NT | Enligt överenskommelse | Folkhälsomyndigheten | 3 735 kr |
Puumalavirus (svenska stammar), nukleinsyra | PCR | 3 dagar | Folkhälsomyndigheten | 2 445 kr |
Puumalavirus, IgM (snabbtest) | Reascan | 3 dagar | Folkhälsomyndigheten | 825 kr |
Puumalavirus, IgG | IF | 7 dagar | Folkhälsomyndigheten | 1 425 kr |
Sin Nombrevirus, nukleinsyra | PCR | 12 timmar | Folkhälsomyndigheten | 2 445 kr |
(a) Provsvar ges efter telefonkontakt, även jourtid.
Referensmaterial
Norrlands Universitetssjukhus tillhandahåller Puumala- och Sindbisvirus positiva/negativa prov för validering/verifiering vid införande av ny
Referensmaterial | Avgift | Laboratorium/Företag |
---|---|---|
Serum positivt för Puumalavirus RNA och/eller Puumalavirusspecifikt IgG och IgM | Självkostnadspris | Norrlands Universitetssjukhus |
Hantavirus, olika species, inaktiverat material | Självkostnadspris | Folkhälsomyndigheten |
Expertstöd
Norrlands Universitetssjukhus tillhandahåller kvalificerat stöd vid frågor om diagnostik och utredning av patienter med misstänkt infektion, vid utbrott samt vid behov av rådgivning till laboratorier vid etablering, validering och kvalitetssäkring av tester.
Folkhälsomyndigheten ger expertstöd och rådgivning till behandlande läkare och laboratorier angående utredning av patienter där misstanke om hantavirusinfektion och dess differentialdiagnoser föreligger.
Utveckling och samverkan
Norrlands Universitetssjukhus har moderniserat rutindiagnostiken för Puumalavirus, vilket innebär att PCR utförs i första hand på de stora flertalet prover i syfte att öka sensitiviteten och specificiteten. Serologianalyser som tidigare utfördes med IF- metoden för detektion av PUUV specifikt IgG och IgM utförs nu med ELISA (Reagena EIA-test) där avläsningen sker med spektrofotometer. Tillsammans med forskare vid Umeå universitet och Totalförsvarets forskningsinstitut, FOI har laboratoriet utvecklat en NGS-metod för detektion och helgenomsekvensering av hantavirus. Metoden ger möjlighet att detektera och sekvensera hela genom från alla kända hantavirus som kan ge sjukdom hos människa. Metoden är designad för att detektera och sekvensera hittills okända hantavirus. Metoden kan även användas vidutbrottsutredning och vid misstanke om icke-endemiska hanatvirus från övriga världen. Utvecklingsarbete tillsammans med HUS labb i Helsingfors för att införa Sindbisvirus serologi pågår vid laboratoriet.
Folkhälsomyndigheten ingår i ett konsortium för referenslaborotarier inom EU (EU reference laboratory for emerging rodent-borne and zoonotic viruses) med ansvar för bland annat hantavirus.
Under 2024 har Fohm vidareutvecklat sin puumala-PCR med tillägg av ett target för PCR för att kunna detektera stammar som som cirkulerar utanför Sverige. Vid specifik misstanke om andes- eller sin nombrevirus ska fortfarande specifik PCR beställas och vid behov kompletteras med serologiska metoder.
Omvärldsbevakning och beredskap
Norrlands Universitetssjukhus deltar på nationella och internationella virologiska/mikrobiologiska möten med presentation av pågående utvecklingsarbeten.
Folkhälsomyndigheten bedriver kontinuerlig omvärldsbevakning som utvärderas och distribueras till nationella intressenter. Myndigheten får också regelbundet tillgång till global information ifrån WHO och ECDC.
För andesvirus, ett hantavirus som kan smitta mellan människor och ge upphov till allvarlig sjukdom, finns hos Folkhälsomyndigheten en beredskap för att analysera prov dygnet runt inom ramen för beredskapsdiagnostiken.