Nationellt referenslaboratorium för hepatitvirus

Omfattning

Hepatit-A, Hepatit-B, Hepatit-C, Hepatit-D och Hepatit-E.

Referensdiagnostik

Vid laboratoriet utförs komplett serologisk diagnostik samt molekylärbiologisk diagnostik avseende Hepatit A-E. Påvisning av resistensmutationer, genotypning, molekylärepidemiologisk analys samt kvantifiering.

Referensmaterial

I laboratoriets kliniska biobank finns referensmaterial som kan rekvireras för utvärdering av ny metodik eller som positiv kontroll. Priset baserat på tidsåtgång för att tra fram och bereda materialet. Laboratoriet behöver prov fr diagnostiska behov, vilket kan begränsa möjligheten att tillhandahålla vissa prover.

Expertstöd

Expertis inom hepatitfältet finns vid laboratoriet för stöd vid särskilda frågeställningar via telefon eller e-post året runt. Vid akut rådgivning finns jourläkare att tillgå dygnet runt. Följande expertområden laboratoriet kan bistå med: basal virologi, grundvetenskapliga metoder samt diagnostik avseende Hepatit A-E. Resistensmutationsanalys, djupsekvensering samt fylogenetisk analys av Hepatit-C.

Utveckling och samverkan

Laboratoriet har mångårig och omfattande erfarenhet av utveckling av metoder för påvisning av hepatitvirus med realtids-PCR (Hepatit A-E virus), genotypning med realtids-PCR (Hepatit B och C), sekvensering och fylogenetisk analys (Hepatit A-E virus) samt resistensmutationsanalys (Hepatit B och C virus). Sedan flera år tillbaka utför laboratoriet sekvensering av Hepatit C med IonTorrrent eller Sanger för att genotypa eller påvisa resistensmutationer. Typning med Sangersekvensering av hepatit A-virus och hepatit E-virus på uppdrag av smittskyddsenheter i VGR och andra regioner utförs. Laboratoriet får prover och har samarbeten med andra länder avseende sekvensering och typning.

Under senare år har laboratoriet fokuserat på djupsekvensering som applicerats för analys (genotypning, resistensmutationer) av Hepatit B (helgenomsekvensering med IonTorrent och Nanopore) och Hepatit D (sekvensering med Nanopore).

Omvärldsbevakning och beredskap

Laboratoriets forskare håller sig fortlöpande uppdaterade om utvecklingen i hepatitfältet genom att följa litteraturen, deltar i vetenskapliga möten, och bedriver egen forskning. Laboratoriet har nära kontakt med infektionsklinikerna i Göteborg och Smittskyddsenheten i VGR och samverkar i frågor om hepatitdiagnostik med övriga regioner i olika sammanhang. Våra experter inom hepatitområdet följer fältet genom att ta del av publikationer och medverkar i nationella och internationella möten och konferenser inriktae på hepatit (EASL, AASLD, HBV molecular biology meeting med flera). Laboratoriet med mångårig och omfattande erfarenhet av utvecklinga av diagnostiska metoder har en god beredskap att ge stöd och råd vid utbrott och för att bistå med molekylärepidemiologisk utredning.